A változásokról a környezetvédelmi, természetvédelmi, vízügyi hatósági és igazgatási feladatokat ellátó szervek kijelöléséről szóló 347/2006. (XII. 23.) Kormányrendelet rendelkezik. A nemzeti park igazgatóságok működési területét érintő rendelkezések 2007. február 1-én léptek hatályba.

A Kormányrendelet a megszűnő Őrségi Nemzeti Park Igazgatóság általános jogutódjaként a Fertő-Hanság Nemzeti Park Igazgatóságot jelöli meg, amely 2007. február 1-től Fertő-Hanság és Őrségi Nemzeti Park Igazgatóság (ábra) elnevezéssel működik tovább Sarród székhellyel.

A két nemzeti park igazgatóságot érintő rendelkezéseknek megfelelően a nemzeti park igazgatóságok száma 10-ről 9-re csökken.
A nemzeti park igazgatóságok működési területét érintő változások az országos jelentőségű védett természeti területek (beleértve a nemzeti parkokat is) számát és kiterjedését nem érinti, tehát hazánkban továbbra is 10 nemzeti park található.

A nemzeti park igazgatóságok elnevezése és székhelye 2007. február 1-től:

– Aggteleki Nemzeti Park Igazgatóság, Jósvafő
– Balatoni Nemzeti Park Igazgatóság, Csopak
– Bükki Nemzeti Park Igazgatóság, Eger
– Duna-Dráva Nemzeti Park Igazgatóság, Pécs
– Duna-Ipoly Nemzeti Park Igazgatóság, Esztergom
– Fertő-Hanság és Őrségi Nemzeti Park Igazgatóság, Sarród
– Hortobágyi Nemzeti Park Igazgatóság, Hortobágy
– Kiskunsági Nemzeti Park Igazgatóság, Kecskemét
– Körös-Maros Nemzeti Park Igazgatóság, Szarvas


Az Aggteleki Nemzeti Park Igazgatóság működési területe 2007. február 1-el bővült, ezzel egyidejűleg a Bükki Nemzeti Park Igazgatóság működési területe ugyanilyen mértékben csökkent.

A korábban a Bükki Nemzeti Park Igazgatóság működési területén lévő, egyedi jogszabállyal védetté nyilvánított országos jelentőségű védett természetek közül a Tokaj-Bodrogzug Tájvédelmi Körzet, a Zempléni Tájvédelmi Körzet, továbbá a Bodrogszegi Várhegy Természetvédelmi Terület, az Erdőbényei-fáslegelő Természetvédelmi Terület, a Füzérradványi park Természetvédelmi Terület, a Long-erdő Természetvédelmi Terület, a Megyaszói-tátorjános Természetvédelmi Terület, a Megyer-hegyi Tengerszem Természetvédelmi Terület, a Sóstói-legelő Természetvédelmi Terület és a Tállyai Patócs-hegy Természetvédelmi Terület az Aggteleki Nemzeti Park működési területére került át.

A Kormányrendelet az Aggteleki Nemzeti Park Igazgatóság működési területét 2007. február 1-i hatállyal az alábbiak szerint állapítja meg:

Borsod-Abaúj-Zemplén megye területéből
a Sajó, a Hernád és az országhatár által bezárt terület, továbbá
Abaújalpár
Abaújkér
Abaújszántó
Abaújvár
Alsóberecki
Alsódobsza
Alsóregmec
Arka
Baskó
Bekecs
Bodroghalom
Bodrogkeresztúr
Bodrogkisfalud
Bodrogolaszi
Boldogkőújfalu
Boldogkőváralja
Bózsva
Cigánd
Dámóc
Erdőbénye
Erdőhorváti
Felsőberecki
Felsődobsza
Felsőregmec
Filkeháza
Fony
Füzér
Füzérkajata
Füzérkomlós
Füzérradvány
Gesztely
Golop
Gönc
Göncruszka
Györgytarló
Háromhuta
Hejce
Hercegkút
Hernádbűd
Hernádcéce
Hernádkércs
Hollóháza
Karcsa
Karos
Kéked
Kenézlő
Kishuta
Kisrozvágy
Komlóska
Korlát
Kovácsvágás
Lácacséke
Legyesbénye
Mád
Makkoshotyka
Megyaszó
Mezőzombor
Mikóháza
Mogyoróska
Monok
Nagyhuta
Nagykinizs
Nagyrozvágy
Nyíri
Olaszliszka
Pácin
Pálháza
Pányok
Pere
Pusztafalu
Rátka
Regéc
Révleányvár
Ricse
Sárazsadány
Sárospatak
Sátoraljaújhely
Semjén
Sima
Sóstófalva
Szegi
Szegilong
Szentistvánbaksa
Szerencs
Tállya
Tarcal
Telkibánya
Tiszacsermely
Tiszakarád
Tiszaladány
Tokaj
Tolcsva
Újcsanálos
Vágáshuta
Vajdácska
Vámosújfalu
Vilmány
Vilyvitány
Viss
Vizsoly
Zalkod
Zemplénagárd
Zsujta


A Bükki Nemzeti Park Igazgatóság működési területe 2007. február 1-től:

a) Borsod-Abaúj-Zemplén megye területe – kivéve az Aggteleki Nemzeti Park Igazgatóság működési területe.
b) Heves megye.
c) Nógrád megye.
d) Szabolcs-Szatmár-Bereg megye területén:
a Kesznyéteni TK területe Tiszadob községhatárban.
e) Jász-Nagykun-Szolnok megye területén:
a Hevesi füves puszták TK területe Jászivány községhatárban.