A közvetlen természetvédelmi beruházások forrásainak döntő részét az Európai Regionális Fejlesztési Alap adja – a 2004-2006 időszakban a Környezetvédelem és Infrastruktúra Operatív Program (KIOP), a 2007-2013 időszakban a Környezet és Energia Operatív Program (KEOP), illetve a Közép-Magyarország Operatív Program (KMOP), míg a pénzügyileg 2023-ban záruló 2014-2020 időszak során a Környezeti és Energiahatékonysági Operatív Program (KEHOP), valamint a Versenyképes Közép-Magyarország Operatív Program (VEKOP). E programok keretében összesen 333 egyedi beruházás (projekt) valósult meg, összesen mintegy 89 milliárd forint fejlesztési forrás felhasználásával, az alábbi táblázatban látható megoszlás szerint.

Az Európai Unió kohéziós forrásai és a hozzájuk rendelt nemzeti társfinanszírozás felhasználásával a 2007-2013, illetve a 2014-2020 időszakban megvalósuló természetvédelmi fejlesztések révén összességében mintegy 300 000 hektárnyi területen javítottuk, illetve javítjuk a veszélyeztetett élőhelyek állapotát, és biztosítjuk a természeti értékek hosszú távú fennmaradásához szükséges ökológiai és műszaki feltételeket.

A természetvédelmi kezelés fontos eleme a természeti értékek bemutatása, a természeti értékek lakossággal történő megismertetése és minél mélyebb, élményszerű megismerés feltételeinek megteremtése. E célt szolgálják a 2014-2020 időszakra szóló Gazdaságfejlesztési és Innovációs Operatív Program (GINOP) keretében biztosított mintegy 4 milliárd forint keretösszegből megvalósuló nemzeti parki ökoturisztikai beruházások, amelyek eredményeként család- és környezetbarát látogatóközpontok épülnek, illetve bővülnek a nemzeti park igazgatóságok kiemelt helyszínein, a természeti értékek bemutatása mellett hozzájárulva a helyi szolgáltatások jobb kihasználásához és a vendégéjszakák számának további növeléséhez.

Az operatív programokról, felhívásokról és nyertes projektekről bővebb információ a https://www.palyazat.gov.hu/ oldalon található.

A fentieken túl a természetvédelmi kezelést és a természeti értékek megőrzését támogató fejlesztések megvalósításában fontos szerep jut a LIFE program természetvédelmi alprogramja keretében finanszírozott fejlesztéseknek valamint a határon átnyúló INTERREG programok egyes fejlesztéseinek. Ezek további közel 20 milliárd forint természetvédelmi célokra történő felhasználását tették lehetővé a 2014-2020 időszakban.